某些材料常用的添加型阻燃剂，在材料加工温度下可能会发生少量分解，这一方面限制了某些阻燃剂的使用，另一方面也限制了阻燃材料所采用的加工温度。有很多添加型阻燃剂是填料型的，而为了使材料达到所要求的阻燃级别，往往所需要的添加量较大，因而难于全部在聚合物基体中均匀分散，这又可能降低材料的某些性能。
材料常用的卤系阻燃剂与氧化锑组成的协效系统，虽然能赋予材料很高的氧指数与UL94阻燃级别，能满足很多对火灾要求严格场所的使用范围，但此系统热解及燃烧的时候发烟量比较大，且产生有毒和腐蚀性气体。
而当固态阻燃剂的用量很高时，它们熔融聚合物中也难于分散均匀，不良的分散会加剧聚合物的脆性，也会降低阻燃效果。将阻燃剂制成母粒（加工成本过高），或用偶联剂对阻燃剂进行表面处理（目前普遍使用），可以很好的改善阻燃剂在材料中的分散情况。
阻燃剂的另一个问题就是会降低材料的耐光性，而且光稳定剂受阻胺的效果为卤系阻燃剂严重恶化。无机阻燃剂在此方面会稍优于卤系阻燃剂，例如，氧化锌就能大大降低这类添加剂的热老化时间。
与阻燃材料有关的问题还有价格、回收、生态等，一般而言，阻燃材料的价格比未阻燃的要高些，阻燃材料的循环再利用也比未阻燃材料困难。尽管使用阻燃材料是需要付出成本的，但是权衡阻燃产品在当今社会中，提高防火安全性，减少火灾中人民生命财产的损失及环境保护方面的突出贡献，阻燃仍然是我们必要和明智的选择。
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